IPB Temukan Gen Resistansi Antimikrob pada Bakteri E. coli

Keberadaan gen resistansi antimikrob pada bakteri Escherichia coli (E. coli) di lingkungan pemotongan hewan menjadi temuan penting dalam penelitian IPB University. Hasil studi di Provinsi Banten menunjukkan adanya potensi penyebaran resistansi antimikrob melalui rantai pangan.

Temuan tersebut perlu mendapat perhatian karena materi genetik pembawa resistansi dapat berpindah dari satu bakteri ke bakteri lainnya. Informasi penelitian ini dilansir dari Detikcom berdasarkan keterangan IPB University pada Rabu (4/11/2026).

Guru Besar Sekolah Kedokteran Hewan dan Biomedis (SKHB) IPB University, Prof drh Hadri Latif, menjelaskan bahwa pangan menjadi salah satu jalur perpindahan mikroorganisme yang sudah memiliki kemampuan bertahan terhadap antimikrob.

"Salah satu jalur mikroorganisme yang sudah resistan terhadap antimikrob untuk berpindah itu adalah melalui pangan," ujar Hadri.

Perpindahan gen resistansi dapat berlangsung melalui mekanisme transfer gen antarbakteri. Akibatnya, bakteri penyebab penyakit berpotensi semakin sulit dikendalikan apabila antimikrob yang tersedia tidak lagi mampu memberikan respons pengobatan yang efektif.

Penelitian genomik mengungkap pola resistansi bakteri

Penelitian berjudul Membaca Jejak Resistansi Antimikrob: Pendekatan Genomik untuk Kebijakan Berbasis One Health di Indonesia telah berlangsung di Banten sejak 2023. Kajian tersebut menghubungkan data dari tiga sektor, yakni manusia, hewan, dan lingkungan.

Pendekatan One Health digunakan untuk melihat resistansi antimikrob sebagai persoalan yang saling berkaitan. Dengan demikian, pengamatan tidak hanya berpusat pada bakteri yang ditemukan pada manusia, tetapi turut memperhitungkan kondisi hewan dan lingkungan.

Untuk mengidentifikasi karakter genetik bakteri, peneliti menerapkan teknologi whole-genome sequencing (WGS). Metode ini membantu menemukan gen resistansi antimikrob atau antimicrobial resistance genes (ARG), sekaligus mengidentifikasi keberadaannya pada plasmid maupun kromosom.

Analisis tersebut juga digunakan untuk memperkirakan kemungkinan bakteri memiliki resistansi terhadap beberapa kelompok antimikrob sekaligus. Kemampuan tersebut dikenal sebagai multidrug resistance (MDR).

Pada sampel yang berasal dari ekosistem pemotongan babi, ditemukan gen resistansi yang berkaitan dengan 12 kelas antimikrob. Hasil pemeriksaan genomik juga memperlihatkan potensi MDR terhadap tiga kelas antimikrob atau lebih.

Proporsi isolat yang menunjukkan potensi tersebut mencapai 90 persen pada sampel hewan. Sementara itu, hasil pada sampel lingkungan sebesar 40 persen dan sampel manusia mencapai 12,7 persen.

Angka tersebut menggambarkan komposisi isolat yang diperiksa dalam penelitian, bukan prevalensi bakteri resisten secara keseluruhan di Provinsi Banten. Karena itu, hasilnya perlu dipahami sesuai cakupan sampel yang digunakan peneliti.

Plasmid berperan dalam perpindahan gen resistansi

Salah satu bagian penting dari hasil penelitian berkaitan dengan lokasi gen resistansi pada materi genetik bakteri. Hadri menyebut sebagian besar gen yang ditemukan pada isolat E. coli dari hewan dan lingkungan berada di plasmid.

"Pada isolat E. coli dari hewan dan lingkungan, sekitar 85 persen gen resistansinya ditemukan pada plasmid," jelas Hadri.

Plasmid merupakan molekul DNA yang terletak di luar kromosom bakteri. Struktur genetik tersebut dapat membawa informasi resistansi antimikrob dan, pada jenis tertentu, memungkinkan perpindahan materi genetik melalui proses konjugasi.

Keberadaan gen pada plasmid menjadi perhatian karena materi genetik tersebut berpotensi berpindah antarbakteri. Mekanisme ini merupakan salah satu jalur yang dapat berkontribusi terhadap penyebaran sifat resistansi.

Penelitian juga menemukan perubahan terkait gen mcr-1.1 yang berhubungan dengan resistansi terhadap kolistin. Gen tersebut teridentifikasi dalam sampel 2023, tetapi tidak ditemukan kembali pada sampel 2026.

Menurut Hadri, perubahan hasil pengamatan tersebut sejalan dengan penghentian penggunaan kolistin pada hewan. Temuan ini menjadi bagian dari gambaran perubahan pola gen resistansi yang diamati selama penelitian.

Meski demikian, identifikasi gen melalui pemeriksaan genomik tidak sama dengan pembuktian langsung tingkat kepekaan bakteri terhadap obat. Keberadaan gen menunjukkan potensi resistansi, sedangkan pengujian kepekaan antimikrob diperlukan untuk mengetahui respons bakteri secara langsung.

Penggunaan antibiotik perlu mengikuti petunjuk dokter

Selain mengamati penyebaran gen resistansi, penelitian tersebut menjadi pengingat mengenai pentingnya penggunaan antibiotik secara tepat. Hadri meminta masyarakat tidak mengonsumsi obat tersebut sembarangan, terutama ketika mengalami keluhan seperti batuk dan pilek.

Keluhan pernapasan tersebut tidak selalu disebabkan oleh infeksi bakteri. Sebagian besar kasus batuk dan pilek berkaitan dengan infeksi virus sehingga antibiotik bukan pengobatan yang tepat untuk mengatasinya.

"Batuk pilek belum tentu penyebabnya bakteri bahkan penyebab utamanya adalah virus. Padahal virus tidak bisa diobati dengan antibiotik," ungkap Hadri.

Antibiotik bekerja untuk membantu menangani infeksi bakteri, bukan mengatasi penyakit yang disebabkan virus. Penggunaan obat ini tanpa kebutuhan yang tepat dapat mendorong munculnya bakteri yang memiliki kemampuan bertahan terhadap antimikrob.

Ketika resistansi berkembang dan menyebar, penanganan infeksi bakteri berpotensi menjadi lebih sulit. Kondisi tersebut berkaitan dengan temuan penelitian mengenai keberadaan gen resistansi pada isolat dari sektor hewan, manusia, dan lingkungan.

Hadri menegaskan bahwa antibiotik merupakan obat yang dikembangkan untuk membantu pengobatan manusia. Oleh sebab itu, penggunaannya harus memperhatikan resep serta petunjuk dokter agar tidak dilakukan secara berlebihan maupun tanpa indikasi yang sesuai.